神崎响，ＳＮＮ电视台的新闻记者，为了拍摄在木星四周爆发的地球军与杰拉帝人的战争而作为飞行员飞上了太空。延续超时空要塞Ｉ战法，地球军使用林明美的歌声以摧毁杰拉帝人的战斗意志，但这次出现的杰拉帝人同样也使用了歌巫女的战歌以激厉士气，地球军一直所恃的林明美的歌声无法发挥作用，地球军于是一路败退。
在战场上驾机左冲右突以拍摄战场场面的神崎响与戴尼斯，冲入了一艘杰拉帝人的战舰内部，没想到被敌人发现差点没命，在战斗过程中他们发现了一名昏迷中的杰拉帝人歌巫女，戴尼斯执意要带歌巫女回地球，但是在预备返航的过程中戴尼斯因战舰爆炸重伤殉职，神崎响于是带着歌巫女驾机逃回了地球。军方为掩盖事实而压制了神崎响的报道，神崎响也隐瞒了将杰拉帝人歌巫女带回地球的事……
但是，杰拉帝人并没有放弃寻回歌巫女，一小队杰拉帝人的精锐战士潜入地球，但是身为杰拉帝人歌巫女的伊修塔尔却在地球文化的感染下开始对杰拉帝人为战争而生为战争而死的生存法则发生了疑问……